R&D en microbiologie conventionnelle

MALDI-TOF en microbiologie clinique

Le MALDI-TOF est une technologie émergente qui révolutionne l'identification bactérienne et que nous utilisons depuis mars 2009. Notre programme de R&D nous a permis de préciser le protocole idéal pour chaque situation pratique. Ainsi, à titre d'exemple, nous avons développé une procédure à base de chlorure d'ammonium pour obtenir un culot bactérien provenant d'hémocultures positives qui peut être testé par MALDI-TOF (Prod’hom et al. 2010). Nous avons également démontré l'utilité du MALDI-TOF pour l'identification microbienne dans le laboratoire diagnostic de routine ((Bizzini et al. 2010, Croxatto et al. 2012, Clerc et al. 2013, Clerc et al. 2014, Vogne et al. 2014).

La bactériémie est une affection grave associée à une mortalité significative, nécessitant un diagnostic étiologique précoce. Pour réduire le temps séparant la positivité d'une bouteille d'hémoculture de l'identification bactérienne, nous avons tout d'abord mis en oeuvre une procédure à base de chlorure d'ammonium pour obtenir un culot bactérien qui peut être testé par MALDI-TOF (voir ci-dessus) en complément d'autres approches telles que les cartes d'identité Vitek. Il est à noter que les tests de sensibilité aux antibiotiques utilisant l'approche Vitek sont également réalisables et exacts à partir de ces culots bactériens (Prod'hom et al. 2010, Prod'hom et al. 2013, Croxatto et al. 2014, Opota et al. 2015).