Le Bloc opératoire principal du CHUV se situe à l'étage 05 du bâtiment hospitalier (BH). Il dispose, pour accueillir les patient-e-s, de 19 salles d'opération, ainsi que de deux salles de réveil (adulte et pédiatrique).

Au quotidien, 15 salles d'opération sont ouvertes pour les interventions programmées, deux à trois salles pour les interventions en urgences. Il constitue un plateau technique multidisciplinaire à la disposition des patients devant subir une intervention chirurgicale.

Le Centre d'endoscopie est une plateforme technique multidisciplinaire dans laquelle interviennent six disciplines médicales.

Y sont accueillis la majorité des patients devant subir une intervention au moyen d'un endoscope. Cet instrument est muni d'une lunette optique, que l'on introduit par un orifice naturel et qui permet d'inspecter, voire d'opérer, à l'intérieur d'organes comme l'estomac, le côlon, le rectum, l'oesophage, les bronches, la vessie, etc.

Deux tiers des interventions se font en ambulatoire.