Le CHUV partenaire d’une publication majeure de MOSAIC

Le consortium MOSAIC (Multi-Omics Spatial Atlas in Cancer) publie dans Genome Medicine un article majeur présentant l’une des plus vastes initiatives internationales de caractérisation multi-omique spatiale des cancers. Ce projet ambitieux a permis de profiler plus de 2 700 échantillons tumoraux de plusieurs types de cancers afin de mieux comprendre l’hétérogénéité intratumorale et son éventuel impact sur la prise en charge des patients. 

MOSAIC s’appuie sur les dernières avancées technologiques pour combiner l’histologie, la transcriptomique spatiale et le séquençage de l’ARN unicellulaire avec d’autres types de données complémentaires, notamment le séquençage du transcriptome et de l’exome. Cette approche intégrée permet d’obtenir une compréhension spatiale globale des caractéristiques histologiques, génomiques et transcriptomiques des cancers. En croisant ces différentes sources de données, elle met en évidence des mécanismes biologiques et des interactions complexes qui ne pourraient être détectés par une technologie utilisée seule.

Cette publication présente également MOSAIC Window, première base de données mis à la disposition de la communauté scientifique, regroupant des données provenant de 60 patients et couvrant 5 types de cancers (le carcinome urothélial de la vessie, l’adénocarcinome séreux de l’ovaire, le glioblastome multiforme, le lymphome diffus à grandes cellules B et le mésothéliome). 

Les premières analyses démontrent la puissance de l’approche multi-omique pour quantifier l’hétérogénéité interindividuelle et au sein d’une même tumeur, identifier des sous-groupes tumoraux distincts et décoder les interactions entre les cellules tumorales et leur microenvironnement. 

Le CHUV a joué un rôle essentiel dans cette initiative internationale grâce à l’implication de plusieurs partenaires clés du consortium, à savoir le Service d’Oncologie, représenté par le Dr Krisztian Homicsko, le Biomedical Data Science Center (BDSC), représenté par le Pr Raphael Gottardo, ainsi que l’Institut Universitaire de Pathologie, représenté par la Pre Laurence de Leval. Leur expertise en matière d’oncologie et onco-hématologie clinique, de pathologie et de sciences computationnelles, a contribué de manière significative à la constitution de cette ressource unique et à l’avancement de la recherche en oncologie de précision. 

En établissant une infrastructure standardisée de données multi-omiques à grande échelle, MOSAIC ouvre de nouvelles perspectives pour la compréhension de la biologie des tumeurs et le développement de stratégies thérapeutiques plus personnalisées.
De nouvelles vagues de données sont déjà prévues, renforçant encore la valeur de cette ressource pour la communauté scientifique internationale. 

Pour en savoir plus sur le consortium MOSAIC 

Lien vers la publication