Making Sense of Spatial Omics Data

Le Biomedical Data Science Center (BDSC) a le plaisir de vous inviter à un séminaire de Jean Yang, Professeure de statistique et de bioinformatique à l'Université de Sydney et Directrice du Sydney Precision Data Science Centre.

Elle donnera une conférence intitulée : Making Sense of Spatial Omics Data: Designing, Reconstructing and Interpreting Tissue Maps

Résumé

Les technologies de spatial omics transforment notre capacité à étudier l’organisation des tissus. Toutefois, l’analyse de coupes tissulaires complètes sur de larges cohortes de patients demeure coûteuse et techniquement complexe. De nombreuses études s’appuient donc sur des régions d’intérêt sélectionnées, des mesures limitées ou des panels moléculaires partiels. Une question centrale se pose alors : comment reconstruire des cartes tissulaires biologiquement pertinentes à partir de données spatiales incomplètes ?

Lors de cette présentation, la Prof. Yang exposera des approches statistiques et computationnelles pour concevoir, reconstruire et interpréter des expériences de spatial omics. Elle montrera notamment comment l’histologie H&E peut servir de référence structurelle pour guider le profilage moléculaire et inférer les régions non mesurées. Elle présentera également des stratégies d’optimisation multi-objectifs permettant de sélectionner des zones représentatives tout en conciliant couverture tissulaire, diversité moléculaire et objectifs translationnels. Enfin, elle abordera l’application de concepts similaires à l’analyse de la protéomique spatiale, notamment pour l’évaluation de la qualité des données et l’interprétation robuste des mesures au niveau cellulaire.

À propos de l'intervenante

La Pre Jean Yang est Professeure de statistique et de bioinformatique à l'Université de Sydney, Directrice du Sydney Precision Data Science Centre et NHMRC Investigator Leadership Fellow. Ses recherches portent sur le développement de méthodes statistiques et d'apprentissage automatique pour l'intégration de données omiques et cliniques, avec des contributions majeures dans les domaines du single-cell et du spatial omics. À l'interface entre statistiques, biomédecine et santé, elle collabore étroitement avec des équipes interdisciplinaires afin de développer des approches translationnelles pour la recherche biomédicale. En 2022, elle a été nommée Senior Fellow de l'Australian Bioinformatics and Computational Biology Society.

Nous espérons vous voir nombreux à cette occasion !